CSU2017107 Bioinformatik - anvend og forstå de hyppigst anvendte værktøjer
Bioinformatics - use and understand the most frequently used tools
Klik her for at gå til kursusside
Forskningen i bioteknologi og molekylær biologi er i rivende udvikling, og efterhånden kan man kun få noget ud af de enorme mængder af offentligt tilgængelige viden og information inden for området med en basal bioinformatisk viden. Samtidig opleves bioinformatik som fag ofte vanskeligt tilgængeligt og svært at formidle.
Dette kursus henvender sig til gymnasieundervisere og andre med
formidlingsopgaver inden for bioinformatik. Undervisningen sigter
på at gøre deltagerne i stand til, ved hjælp af computere og
statistiske værktøjer, at ekstrahere, behandle og formidle relevant
viden fra de store mængder af biologisk information, der i dag er
frit tilgængelig på internettet. Herunder at integrere den nyeste
forskning og viden med relevante, praktiske og gratis
bioinformatoriske værktøjer. Kurset vil på en effektiv og
anvendelsesorienteret måde opdatere gymnasieundervisere og andre
med problemstillinger og formidlingsopgaver inden for
bioinformatik. Undervisningen vil gøre deltagerne i stand til, ved
hjælp af computere og statistiske værktøjer, at ekstrahere og
behandle relevant biologisk viden fra de store mængder af biologisk
information, der i dag er frit tilgængelig på internettet.
Dit udbytte
Du får up-to-date viden om og kompetencer i brug af sekvens- og genom-databaser, DNA- og protein- sekvens analyse og alignment, molekylær fylogeni samt protein 3D-visualisering og homologi modellering. Ovenstående kompetencer udvikles i et ’hands-on’-miljø og ud fra de bedst tilgængelige online værktøjer.
Efter endt kursus er du i stand til:
- At finde relevante DNA og proteinsekvenser fra internetbaserede databaser
- At analysere og aligne relevante DNA og protein sekvenser
- At generere og fortolke fylogenetiske træer på baggrund af dine egne alignments
- At modellere og visualisere 3D strukturen af relevante
proteiner.
Ovenstående vil du kunne bruge til egen udvikling af
undervisningsmateriale til brug i gymnasieskolen. Undervejs i
kursusforløbet vil der også være tid til at spørge ind til dine
egne bioinformatiske udfordringer. Endelig vil underviserne
facilitere dannelsen af fagligt netværk blandt deltagerne, der gør
det muligt for deltagere at fagligt understøtte og supportere
hinanden efter endt kursus.
Kursusindhold
Kurset omfatter en blanding af forelæsninger og
problemorienteret undervisning i form af computerøvelser.
Computerøvelserne vil kunne inddrages enten direkte eller i
modificeret form i undervisning i gymnasieskolen.
Deltagere
Kurset er både henvendt til dig, der har brug for en genopfriskning og hands-on erfaring, men også til dig, der ikke har prøvet kræfter med bioinformatik før.
Kurset er målrettet undervisere i gymnasieskolen, som ønsker
kompetencer til at planlægge og udføre undervisning i
bioinformatik, men også andre med tilsvarende opgaver og
forudsætninger kan få et højt udbytte af kurset.
Datoer
3 dage, 14. – 16. august 2017, 9:00 – 16:30, Københavns
Universitet, Frederiksberg Campus.
Kursusleder
Mika Zagrobelny, lektor, Institut for Plante-
og Miljøvidenskab, Københavns Universitet – sekvens- og
genom-databaser, sekvens alignments, molekylær fylogeni
Andre undervisere
Lars Hemmingsen, lektor, Kemisk Institut, Københavns Universitet – 3D protein struktur modellering
Aldo Ricardo Almeida Robles, Postdoc, Institut for Plante- og Miljøvidenskab, Københavns Universitet – assisterer ved computerøvelser
Pris
11.400 kr. ekskl. moms. Prisen inkluderer undervisning, kursusmateriale og forplejning under kurset.
Dit udbytte
Du får up-to-date viden om og kompetencer i brug af sekvens- og genom-databaser, DNA- og protein- sekvens analyse og alignment, molekylær fylogeni samt protein 3D-visualisering og homologi modellering. Ovenstående kompetencer udvikles i et ’hands-on’-miljø og ud fra de bedst tilgængelige online værktøjer.
Efter endt kursus er du i stand til:
- At finde relevante DNA og proteinsekvenser fra internetbaserede databaser
- At analysere og aligne relevante DNA og protein sekvenser
- At generere og fortolke fylogenetiske træer på baggrund af dine egne alignments
- At modellere og visualisere 3D strukturen af relevante proteiner.
Ovenstående vil du kunne bruge til egen udvikling af undervisningsmateriale til brug i gymnasieskolen.
- Kategori
- Timer
- Holdundervisning
- 40
- I alt
- 40
Tilmelding foretages fra kursusside Klik her for at gå til kursusside
- Point
- 0 ECTS
- Prøveform
- KursusdeltagelseIngen
- Bedømmelsesform
- Ingen bedømmelse
- Censurform
- Ingen ekstern censur
Kriterier for bedømmelse
Ingen
Kursusinformation
- Sprog
- Dansk
- Kursuskode
- CSU2017107
- Point
- 0 ECTS
- Niveau
- Bachelor
- Varighed
- Placering
- Sommer
- Skemagruppe
- 14. – 16. august 2017
- Kursuskapacitet
- 24
- Efter- og videreuddannelse
- Pris
11.400 kr. ekskl. moms
- Studienævn
- Indtægtsdækket virksomhed
Udbydende institut
- Institut for Plante- og Miljøvidenskab
Kursusansvarlige
- Mika Zagrobelny (3-6f6b7c42726e6770306d7730666d)