NKEB14014U Makromolekyler, cofaktorer og metalioner og deres kemi i biologiske systemer
Chemistry of Macromolecules, Cofactors and Metal Ions in Biological Systems
Bacheloruddannelsen i naturvidenskab og IT
Bacheloruddannelsen i biologi-bioteknologi
Kurset inddrager makromolekylernes, cofaktorernes og
metal-ionernes molekylære egenskaber, aspekter omkring deres
isolering, analyse og strukturopklaring, herunder internetsøgning
og visualisering af strukturinformation. Kurset vil også gennemgå
relevante principper bag en række instrumentelle metoder til
studier af proteinstruktur, metalloproteiner samt vekselvirkning
mellem metalioner og makromolekyler, anvendelse af
computerprogrammer til visualisering af molekylræe egenskaber,
beskrivelse af biologiske væskers ligevægtsforhold, redoxenzymers
funktion og kinetik, modelforbindelser, metalioners betydning for
ernæring og i medicinen.
Mere specifikke emner for forelæsninger og projekter kan således
være:
- karakterisering, reaktivitet og kemisk modificering af peptider
og proteiner
- cofaktorer og metalioner i biologiske systemer, klassificering,
speciering og funktion.
- konformation og foldning af proteiner, den fysiske kemi bag
foldning og ligevægt i opløsning
- protein-substrat/ligand vekselvirkning
- metalloproteiner, klassificering og funktion, redoxaktive
metalloproteiner,
elektrontransport i biologiske systemer.
- struktur-funktion sammenhænge i (metallo)enzymer.
- biovisualisering - protein struktur databaser og deres
anvendelse. Forudsigelse af proteiners 2D og 3D struktur.
- membranproteiner og andre aspekter af vekselvirkningen mellem
biomolekyler og memebraner
Makromolekyler, cofaktorer og metal-ioner og deres kemi i
biologiske systemer er et kursus, der fokuserer på makromolekylers
molekylære struktur og vekselvirkninger. Der er specielt fokus på
den rolle som såvel bio-organiske som bio-uorganiske co-faktorer
samt metal-ioner spiller i biomolekylære processer. Der er primært
fokus på proteiner, men udvalgte dele af peptiders, lipiders,
kulhydraters og DNA/RNA's biologiske kemi kan behandles,
herunder sammenhænge mellem struktur, kemiske og fysisk-kemiske
egenskaber og biologisk funktion. Ligeledes gives en teoretisk
indføring i metal-ioners kemi og deres betydning i makromolekylers
kemi - specielt med henblik på proteiner.
Kurset er tænkt som en videreføring af den grundlæggende
undervisning i kemi og biokemi og danner et fundament for
videregående uddannelse indenfor bioteknologi samt biomedicinsk og
biologisk kemi.
Kurset implementerer undervisningselementer der sigter mod
aktivering og stimulering af aftagerne, men samtidig kræver en
studieindsats præget af selvstændighed. Dette udmøntes primært i et
større problem-baseret gruppearbejde med et væsentligt element af
selvvalg og formulering af egne mål.
Det vigtigste læringsmæssige mål for kurset er at introducere
forskningsmetodik i undervisning, herunder literatursøgning og
behandling af primær forskningsliteratur, samt formulering af egne
problemstillinger og hypoteser.
Mål for opnåelse af viden:
- Redegøre for grundlæggende aspekter af makromolekylers 3D
struktur og dynamik inkl. vekselvirkninger med co-faktorer og
metal-ioner.
- Beskrive molekylære sammenhænge indenfor makromolekylers
rektionskinetik og reaktionsmekanismer
- Redegøre for grundlæggende eksperimentelle teknikker til
fastlæggelse af makromolekylers kemiske og fysisk-kemiske
egenskaber
Mål for opnåelse af færdigheder:
- Søge primær litteratur indenfor fagområdet inkl. vurdering af
kvalitet, relevans og anvendelighed.
- Søge og anvende strukturdata til forudsigelser af
struktur-funktionssammenhænge
- Udnytte IT ved behandling og præsentation af resultater, herunder
information fra databaser
- Fortolke eksperimentelle spektroskopiske og kinetiske data
- Analysere relevante problemstillinger for metal-ioners betydning
for biologien.
Mål for opnåelse af kompetencer:
- Anvende teoretiske principper og forskningsresultater til
hypotese- og teoridannelse omkring makromolekylers funktion og
reaktionsmekanismer.
- Udnytte viden om makromolekylers og metal-ioners kemiske
egenskaber på et molekylært niveau i design af eksperimentelt
arbejde.
- Overføre viden og færdigheder inden for fagområdets primære
litteratur til andre sammenhænge og at kunne samarbejde og
kommunikere effektivt omkring dette.
- Have opnået et bedre erkendelsesmæssigt grundlag for at kunne
reflektere over kvaliteten af videnskabelig literatur.
Projektarbejdet involverer selvvalgt primær literatur. Der benyttes tillige en række opgaver og øvelsesbeskrivelser (til PC øvelser) samt uddrag af lærebøger, som vil være tilgængelig via Absalon hhv. som kompendie i bogladen.
- Kategori
- Timer
- Eksamen
- 1
- Forberedelse
- 81
- Forelæsninger
- 32
- Kollokvier
- 8
- Projektarbejde
- 60
- Teoretiske øvelser
- 16
- Vejledning
- 8
- I alt
- 206
Som meritstuderende - klik her!
Som enkeltfags-studerende (efter- og videreuddannelse) - klik
her!
- Point
- 7,5 ECTS
- Prøveform
- Mundtlig prøve, 30 min. med opsyn.Ved den afsluttende mundtlige eksamen, eksamineres i to dele af det til kurset hørende materiale.
1) Eksaminantens eget udførte projektarbejde, idet det udarbejdede produkt (rapport, poster, video, hjemmeside el. lign.) danner udgangspunktet for eksaminationen.
2) En til pensum opgivet videnskabelig artikel med relation til et af de projektemner, der har været behandlet ved årets kursus af en af de øvrige grupper. - Krav til indstilling til eksamen
Deltagelse i projektarbejde, specifikt opgivelse af én artikel til eksaminering samt medforfatterskab af rapport, poster eller multimediebaseret produkt.
Afleveret og godkendt produkt (rapport, poster, video, hjemmeside el. lign.)- Hjælpemidler
- Alle hjælpemidler tilladt
- Bedømmelsesform
- 7-trins skala
- Censurform
- Ingen ekstern censur
Flere interne bedømmere
- Reeksamen
Det udarbejdede produkt (rapport, poster, video, hjemmeside el. lign.) skal være afleveret og godkendt forud for reeksamen.
Kriterier for bedømmelse
Den mundtlige præstation vægtes ligeligt mellem de to beskrevne delelementer
Kursusinformation
- Sprog
- Dansk
- Kursuskode
- NKEB14014U
- Point
- 7,5 ECTS
- Niveau
- Bachelor
- Varighed
- 1 blok
- Placering
- Blok 4
- Skemagruppe
- B
- Kursuskapacitet
- 30
- Efter- og videreuddannelse
- Studienævn
- Studienævn for Biomolekylær videnskab og Teknologi
Udbydende institutter
- Kemisk Institut
- Institut for Lægemiddeldesign og Farmakologi
- Institut for Veterinær Sygdomsbiologi
Kursusansvarlige
- Peter Waaben Thulstrup (3-767d7a46696e6b7334717b346a71)
Undervisere
Peter W. Thulstrup (30%)
Morten Jannik Bjerrum (20%)
Paul Robert Hansen (20%)
Lars Hemmingsen (15%)
Hanne Frøkiær (15%)