CSU2016102 Bioinformatik – anvend og forstå de hyppigst brugte værktøjer
Bioinformatics
Se kursusbeskrivelsen på kampagnesiden for Copenhagen Summer University
Forskningen i bioteknologi og molekylær biologi er i rivende udvikling, og efterhånden kan man kun få noget ud af de enorme mængder af offentligt tilgængelige informationer med en basal bioinformatisk viden. Samtidig opleves bioinformatik ofte vanskeligt tilgængeligt og svært at formidle.
På kurset vil underviserne integrere den nyeste forskning med relevante, praktiske og gratis bioinformatiske værktøjer, der kan anvendes i undervisningen. Kurset vil på en effektiv og anvendelsesorienteret måde opdatere gymnasieundervisere og andre med problemstillinger og formidlingsopgaver inden for bioinformatik. Undervisningen vil gøre deltagerne i stand til, ved hjælp af computere og statistiske værktøjer, at ekstrahere og behandle relevant biologisk viden fra de store mængder af biologisk information, der i dag er frit tilgængelig på internettet.
Dit udbytte
Deltagerne vil tilegne sig kompetencer, up-to-date viden
om, hands-on erfaring med og state-of-the-art
værktøjer inden for:
Brug af sekvens- og genom-databaser
DNA- og protein- sekvens analyse og alignment
Molekylær fylogeni
Protein 3D visualisering og homologi modellering
Efter endt kursus vil du være i stand til:
At finde relevante DNA og proteinsekvenser fra internetbaserede databaser
At analysere og aligne relevante DNA og protein sekvenser
At generere og fortolke fylogenetiske træer på baggrund af dine egne alignments
- At modellere og visualisere 3D strukturen af relevante proteiner.
Kurset vil bidrage til udviklingen af konkret undervisningsmateriale til brug i gymnasieskolen og vil danne rammen for et fremtidigt fagligt netværk blandt deltagerne. Undervejs vil der også være tid til at spørge om dine egne bioinformatiske problemstillinger.
Kursusindhold
Kurset omfatter en blanding af forelæsninger og problemorienteret
undervisning i form af computerøvelser. Computerøvelserne vil kunne
inddrages enten direkte eller i modificeret form i undervisning i
gymnasieskolen.
Deltagere
Kurset er både henvendt til dig, der har brug for en genopfriskning
og noget hands-on erfaring, men også til dig, der ikke har prøvet
kræfter med bioinformatik før. Det er målrettet undervisere i
gymnasieskolen, som ønsker kompetencer til at planlægge og udføre
undervisning i bioinformatik, men også andre med tilsvarende
opgaver og forudsætninger kan få et højt udbytte af kurset.
Datoer
3 dage, 15. – 17. august 2016, 9:00 – 16:30, Københavns
Universitet, Frederiksberg Campus.
Kursusleder
Mika Zagrobelny, lektor, Institut for Plante- og
Miljøvidenskab, Københavns Universitet – sekvens- og
genom-databaser, sekvens alignments, molekylær fylogeni
Andre undervisere
Lars Hemmingsen, lektor, Kemisk Institut,
Københavns Universitet – 3D protein struktur modellering
Mikael Kryger Jensen, ph.d. stud., Institut for
Plante- og Miljøvidenskab, Københavns Universitet – assisterer
ved computerøvelser
Pris
11.400 kr. ekskl. moms. Prisen inkluderer undervisning,
kursusmateriale og forplejning under kurset.
Se "Dit udbytte"
- Kategori
- Timer
- Forberedelse
- 10
- Holdundervisning
- 35
- I alt
- 45
- Point
- 0 ECTS
- Prøveform
- KursusdeltagelseIngen
- Bedømmelsesform
- Ingen bedømmelse
- Censurform
- Ingen ekstern censur
Kriterier for bedømmelse
Ingen
Kursusinformation
- Sprog
- Dansk
- Kursuskode
- CSU2016102
- Point
- 0 ECTS
- Niveau
- Master
- Varighed
- 3 dage
- Placering
- Sommer
15.-17. august 2016
- Skemagruppe
- Kl. 9-16.30
- Kursuskapacitet
- 24 deltagere
- Efter- og videreuddannelse
- Pris
DKK 11.400 kr. ekskl. moms.
- Studienævn
- Indtægtsdækket virksomhed
Udbydende institutter
- Biologisk Institut
- Institut for Plante- og Miljøvidenskab
Kursusansvarlige
- Mika Zagrobelny (3-6f6b7c42726e6770306d7730666d)