NBIB14029U Proteinvidenskab og enzymteknologi
Protein science and enzyme technology
Undervisningen omfatter proteiners kemiske og strukturelle egenskaber, foldning, stabilitet, og nedbrydning, protein-protein og protein-ligand interaktioner, rekombinant proteinekspression, metoder til proteinoprensning og karakterisering, co- og post-translationelle modifikationer, basal bioinformatik (sekvens- og proteindatabaser samt in silico sekvens- og strukturanalyse), samt udvalgte eksempler til illustration af sammenhængen mellem proteiners struktur og funktion i en cellulær kontekst. Endvidere undervises i enzymmekanismer og regulering, protein-design og engineering samt aspekter af enzym(bio)teknologi. Øvelserne omfatter oprensning og karakterisering at et enzym.
Viden:
- Forstå og redegøre for begreber som domæne, samt similaritet og homologi på både sekvens- og strukturniveau
- Kende centrale sekvens- og strukturdatabaser
- Forstå og redegøre for basale principper indenfor proteinfoldning, stabilitet og nedbrydning samt ubiquitin-proteasomsystemet
- Forstå principperne for membranproteiners strukturelle opbygning
- Forklare principperne for protein-ligand og protein-protein interaktioner, forstå og redegøre for grundlæggende begreber (dissociationskonstant, kooperativitet, aviditet)
- Kende principperne for heterolog proteinekspression i forskellige organismer
- Forstå og redegøre for basale oprensnings- og analyseteknikker så som forskellige kromatografiske metoder, SDS-PAGE, fluorescens- og CD-spektroskopi, samt proteinstrukturbestemmelse ved NMR-spektroskopi og røntgenkrystallografi
- Kende co- og post-translationelle modifikationer og beskrive deres indflydelse på proteiners struktur og cellulære funktion
- Beskrive og forklare enzymmekanismer og regulering af enzymaktivitet i udvalgte biologiske systemer
- Forstå og redegøre for basale principper for protein-design og engineering
- Kende til bioteknologisk anvendelse af proteiner (f.eks. vigtige industrielle enzymer)
Færdigheder:
- Vurdere sammenhængen mellem proteiners struktur og funktion
- Kunne foretage kvantitativ analyse af bindingsdata, f.eks. ved hjælp af et Scatchard plot
- Anvende sekvens og strukturdatabaser samt online ”tools” til basal karakterisering af en proteinsekvens på forskellige strukturniveauer
- Vurdere fordele og ulemper ved heterolog proteinekspression i forskellige organismer
- Kunne beskrive sammenhængen mellem aminosyrers fysisk-kemiske egenskaber, deres reaktivitet og bidrag til proteinstruktur
- Analysere og forklare enzymkinetiske reaktioner ud fra analyser af enzymkinetiske data
- Beskrive udvalgte eksempler på hvordan specifikke proteiners struktur relaterer til deres funktionelle egenskaber i en cellulær kontekst
- Udføre laboratoriearbejde på forsvarlig vis og anvende forskelligartet apparatur i forbindelse med laboratorieøvelser
Kompetencer:
- Dokumentere (vha laboratoriejournal) og præsentere resultaterne af udførte eksperimenter
- Kombinere viden om enzymmekanismer udfra en fortolkning af videnskabelige data
- Læse en original metodebeskrivelse og derfra skrive en forsøgsprotokol
- Kombinere viden om proteinfoldning og stabilitet til en generel forståelse af forholdet mellem in vivo og in vitro proteinfoldning
- Kritisk evaluere fordele og ulemper ved forskellige metoder til proteinoprensning og karakterisering
- Kunne anvende den opnåede viden og færdigheder til at rationalisere et givent proteins “adfærd” baseret på en analyse af forholdet mellem dets struktur, funktion og mekanisme
- Kategori
- Timer
- Eksamen
- 4
- Forberedelse
- 304
- Forelæsninger
- 26
- Praktiske øvelser
- 50
- Teoretiske øvelser
- 28
- I alt
- 412
Som meritstuderende - klik her!
Som enkeltfags-studerende (efter- og videreuddannelse)
- klik her!
- Point
- 15 ECTS
- Prøveform
- Skriftlig prøve, 4 timer med opsyn.---
- Krav til indstilling til eksamen
- Tilstedeværelse ved 80 % af øvelserne
Aflevering og godkendelse af rapport inkl. journal - Hjælpemidler
- Uden hjælpemidler
- Bedømmelsesform
- 7-trins skala
- Censurform
- Ekstern censur
Kriterier for bedømmelse
For at opnå karakteren 12 skal den studerende på overbevisende vis opfylde de beskrevne mål for viden, færidgheder og kompetencer i feltet "Målbeskrivelser".
Kursusinformation
- Sprog
- Dansk
- Kursuskode
- NBIB14029U
- Point
- 15 ECTS
- Niveau
- Bachelor
- Varighed
- 1 blok
- Placering
- Blok 3
- Skemagruppe
- A (tirs 8-12 + tors 8-17), B (man 8-12 + tirs 13-17 + fre 8-12) og C (man 13-17 + ons 8-17)
- Kursuskapacitet
- 125
- Efter- og videreuddannelse
- Studienævn
- Studienævn for Biomolekylær videnskab og Teknologi
Udbydende institut
- Biologisk Institut
Kursusansvarlige
- Lars Ellgaard (9-736c73736e6868796b4769707635727c356b72)
Undervisere
Lars Ellgaard, Kaare Teilum, Karen Skriver, Gert Dandanell, Martin Willemoës