NBIA04007U Biokemi 1: Metabolisme og enzymologi (Biokemi1)

Årgang 2013/2014
Engelsk titel

Biochemistry 1: Metabolism and enzymology (Biokemi1)

Uddannelse
Bacheloruddannelsen i biokemi
Kursusindhold
De basale træk af biokemien behandles. Emnerne er biomolekylers struktur og funktion, energistofskiftet samt nedbrydning og biosyntese af lavmolekylære forbindelser (det intermediære stofskifte). Øvelserne omfatter metabolitter og enzymer i det intermediære stofskifte. Der skal udfærdiges rapport over alle øvelser.
Målbeskrivelser
Viden:
  • redegøre sikkert for processer i det centrale stofskifte som omfatter glycolyse, gluconeogenese, citronsyre cyklus,glyoxylat cyklus, resperationens elektrontransportkæde, oxidativ phosphorylering, pentosephosphatreaktioner, glycogenmetabolisme, lipidmetabolisme, nitrogenmetabolisme (aminosyrer og urinstof cyklus), nukleotidmetabolisme, fotosyntese samt de processor som forbinder dem
  • redegøre overbevisende for energiomsætning (incl. beregning af ændringer i fri energi), lokalisering (celle, væv, organisme) og metabolisk regulering af processer i det centrale stofskifte
  • redegøre for proteiners vekselvirkning med mindre molekyler (ligander), inkl. dissociations-associations ligevægt og mætningsgrad, hyperbolsk såvel som kooperativ
  • redegøre for enzymreaktioners kinetik (hastighed som funktion af substratkoncentration), steady-state approksimationen, Michalis-Menten ligningen, betydningen af de kinetiske parametre (kcat, KM og kcat/KM), enzymhæmning, hæmningstyper, og hæmmerkonstanter (Ki værdier), såvel som regulering af enzymaktivitet ved allosteri
  • kunne redegøre for syre-base katalyse og nukleofile substitutioner i enzymers virkemåde
  • redegøre for principperne bag metabolomics


Færdigheder:
  • velbegrundet redegøre for substrater, cofaktorer, produkter, reaktionstyper og enzymer i balancerede ligninger i processer i det centrale stofskifte
  • anvende de mest almindelig brugte grafiske præsentationer af enzymkinetiske data, mætningskurver, Lineweaver-Burk plots og Hill-plots, og demonstrere en forståelse af, hvordan disse anvendes til estimering af de kinetiske konstanter og hæmningsmønstre
  • anvende nonlinear regression til fitning af data (IT-kat. 1)
  • udføre laboratoriearbejde på forsvarlig vis og anvende forskelligartet apparatur i forbindelse med laboratorieøvelser


Kompetencer:
  • velbegrundet relatere og diskutere de forskellige processers indbyrdes sammenhæng og på overbevisende måde demonstrere en kvantitativ forståelse af metabolitters omsætning (koncentrationer, enzymkinetik, thermodynamik, beregninger i forbindelse med laboratorieøvelser)
  • kunne anvende den opnåede viden og færdigheder til at diskutere og perspektivere biokemiske problemstillinger og processer generelt
Undervisningsmateriale
Se Absalon.
KemiF1, KemiUB, BiologiA1, BiologiA2.
Forelæsninger, laboratorieøvelser
Laboratoriesikkerhed/​arbejdsmiljø: I øvelseskursets indledning indgår en orientering om de personlige værnemidler samt forholdsregler ved uheld (herunder flugtveje og brandslukningsmateriel), ulykker og personskade. Vedr. laboratoriets installationer vil deres rette brug blive genemgået løbende af lærerne i forbindelse med de relevante øvelser. I øvrigt henvises til afsnit om generelle sikkerhedsregler i øvelsesvejledningen. Det er påkrævet, at de studerende bærer kittel ved laboratorieøvelserne.
  • Kategori
  • Timer
  • Eksamen
  • 4
  • E-læring
  • 2
  • Forberedelse
  • 316
  • Forelæsninger
  • 30
  • Praktiske øvelser
  • 32
  • Teoretiske øvelser
  • 28
  • I alt
  • 412
Point
15 ECTS
Prøveform
Skriftlig prøve, 4 timer med opsyn.
---
Krav til indstilling til eksamen
For at kunne indstille sig til eksamen skal begge øvelser og tilhørende rapporter være godkendt. Rapportkravet kan evt. erstattes med aktiv deltagelse i gruppegennemgang af øvelserne.
Hjælpemidler
Uden hjælpemidler
Bedømmelsesform
7-trins skala
Censurform
Ekstern censur
Reeksamen
Hvis begge øvelser er bestået, men ikke rapporterne, skal de manglende rapporter godkendes inden reeksamen. Hvis ikke begge øvelser er bestået, skal de tages det efterfølgende år.
Kriterier for bedømmelse
For at opnå karakteren 12 skal den studerende på overbevisende vis opfylde de beskrevne mål for viden, færdigheder og kompetencer i feltet "Målbeskrivelser".