NBIB14030U Cellebiologi for biokemikere

Årgang 2016/2017
Engelsk titel

Cell Biology for Biochemists

Uddannelse

Bacheloruddannelsen i biokemi

Kursusindhold

Undervisningen har som mål at 1) bygge en konceptuel viden om de vigtigste processer i cellebiologi og 2) integrere, konsolidere og udvide den viden der er opnået i de tidligere kurser (Grundlæggende biovidenskab, Organisk kemi, Metabolisme og enzymologi, Molekylærbiologi, Genetik & Bioteknologi, Proteinvidenskab & Enzymteknologi samt Statistik for biokemikere). Kurset fokuserer på de molekylære aspekter af cellebiologi og reguleringen af de cellulære aktiviteter vha signaleringsprocesser. Der vil blive lagt særlig vægt på en systembiologisk tilgang til at studere cellebiologi samt at lære de studerende hvordan signalerings- netværk og -cross-talk virker og hvordan de kan studeres. “Omics”, "Screening" og data analyse teknologier til at studere genomer, proteomer, interactomer og transcriptomer vil udgøre en vigtig del. De studerende forventes at tage aktiv del i undervisningen både gennem præsentationer og diskussion af original litteratur og skriftlige opgaver.

Målbeskrivelser

Viden:

  • Cellens arkitektur, herunder struktur og funktion af intracellulære organeller.
  • Centrale cellebiologiske teknikker såsom visualisering af celler og deres organeller, fluorescens teknologier, cellefraktionering ved centrifugering, kultivering af celler, og anvendelse af modelorganismer i cellebiologi (f.eks. C. elegans og mus).
  • Stamceller og differentierede celler - eksemplificeret ved muskel og nerveceller
  • Det endomembrane system – vesikeltransport: principperne bag protein lokalisering herunder signaler og mekanismer, der styrer transporten af et protein til dets cellulære destination. Transport af molekyler over plasmamembranen (ion-transport, endo- og exocytose).
  • Generelle principper for signaltransduktion: amplitude, varighed og frekvens af signaler, samt amplifikation, lokalisering og dynamikken af signaler, som påvirker cellulære processer.
  • Hvordan signaler, der starter ved plasmamembranen, kan føre til ændringer i gen- ekspression via en signaleringskaskade illustreret ved udvalgte eksempler (f.eks. insulin). Herunder signaltransduktion via tyrosin kinase receptorer, G protein aktivering og calcium gradienter
  • Nuklear import/export
  • Struktur og funktion af cytoskelettet, den ekstracellulære matrix og deres rolle i cellemigration.
  • Kontrol af celleantal, apoptose og autofagi.
  • Hvordan væv bestående af flere celletyper er organiseret.
  • Hvordan bioinformatik kan anvendes i cellebiologi (cellulomics) herunder anvendelse af "screening"-tekniker og high-throughput mikroskopi til analyse af cellulære fænotyper og analyse af komplekse datasæt.
  • Cellebiologi af immunsystemet.


Færdigheder:

De studerende skal kunne:

  • læse og forstå artikler i biokemiske tidsskrifter
  • præsentere og diskutere biokemisk faglitteratur
  • forklare cellebiologiske processer
  • bruge viden til at løse teoretiske problemer
  • anvende viden til at udføre mindre, teoretiske projekter
  • vurdere projekter, som andre studerende har lavet
  • beskrive og formulere biokemiske problemstillinger i videnskabelig sammenhæng
  • arbejde både selvstændigt og i gruppesammenhæng med biokemiske problemstillinger
  • benytte almindeligt udbredt software samt moderne informationsteknologi til biokemisk arbejde.


Kompetencer:

De studerende skal kunne:

  • forstå, diskutere og evaluere cellebiologiske tekster
  • formidle, skriftligt og mundtligt, faglige problemstillinger under anvendelse af fagligt korrekt terminologi.
  • udføre, afrapportere og præsentere teoretiske projekter
  • være i stand til at vurdere og koordinere viden fra de forskellige emner gennemgået i kurset
Kurserne Grundlæggende biovidenskab, Organisk kemi, Metabolisme og enzymologi, Molekylærbiologi, genetik og bioteknologi, Proteinvidenskab og enzymteknologi, Statistik for biokemikere.
Forelæsninger, projektarbejde, øvelser, e-læring og teoretiske øvelser
Enkelte forelæsninger kan være på engelsk.
Fordelingen på eksaminatoriehold vil blive annonceret på kursets hjemmeside.
  • Kategori
  • Timer
  • Eksamen
  • 3
  • E-læring
  • 10
  • Forberedelse
  • 118
  • Forelæsninger
  • 21
  • Projektarbejde
  • 12
  • Teoretiske øvelser
  • 42
  • I alt
  • 206
Point
7,5 ECTS
Prøveform
Skriftlig prøve, 3 timer med opsyn.
---
Krav til indstilling til eksamen

Alle rapporter skal være godkendt af underviserne.
 

Hjælpemidler
Uden hjælpemidler
Bedømmelsesform
7-trins skala
Censurform
Ingen ekstern censur
Flere interne bedømmere
Reeksamen

Er krav til indstilling til eksamen ikke opfyldt, skal alle rapporter være afleveret senest to uger, inden tilmeldingsperioden til reeksamen slutter. Rapporterne skal være godkendt inden reeksamen.

Kriterier for bedømmelse

For at opnå karakteren 12 skal den studerende på overbevisende måde opfylde de beskrevne mål for viden, færdigheder og kompetencer i feltet "Målbeskrivelser".