NBIB14029U Proteinvidenskab og enzymteknologi
Protein science and enzyme technology
Bacheloruddannelsen i biokemi
Undervisningen omfatter proteiners kemiske og strukturelle egenskaber, aminosyresidekædernes reaktivitet, foldning og stabilitet, protein-protein og protein-ligand interaktioner, rekombinant proteinekspression, metoder til proteinoprensning og karakterisering, co- og post-translationelle modifikationer, basal bioinformatik (sekvens- og proteindatabaser samt in silico sekvens- og strukturanalyse), samt udvalgte eksempler til illustration af sammenhængen mellem proteiners struktur og funktion i en cellulær kontekst. Endvidere undervises i enzymmekanismer og regulering, protein-design og engineering samt aspekter af enzym(bio)teknologi. Øvelserne omfatter oprensning og enzymkinetisk karakterisering at et enzym.
Viden:
- Kende aminosyrernes kemisk reaktive grupper samt almindelige modifikationer af disse brugt til analytiske formål
- Forstå og redegøre for begreber som domæne, samt similaritet og homologi på både sekvens- og strukturniveau
- Kende centrale sekvens- og strukturdatabaser
- Forstå og redegøre for basale principper inden for proteinfoldning, stabilitet og nedbrydning samt ubiquitin-proteasomsystemet
- Forstå principperne for membranproteiners strukturelle opbygning
- Forklare principperne for protein-ligand og protein-protein interaktioner, forstå og redegøre for grundlæggende begreber (dissociationskonstant, kooperativitet, aviditet)
- Kende principperne for heterolog proteinekspression i forskellige organismer
- Forstå og redegøre for basale oprensnings- og analyseteknikker så som forskellige kromatografiske metoder, SDS-PAGE, fluorescens- og CD-spektroskopi, samt proteinstrukturbestemmelse ved NMR-spektroskopi og røntgenkrystallografi
- Kende co- og post-translationelle modifikationer og beskrive deres indflydelse på proteiners struktur og cellulære funktion
- Beskrive og forklare enzymmekanismer og regulering af enzymaktivitet i udvalgte biologiske systemer
- Forstå og redegøre for basale principper for protein-design og engineering
- Kende til bioteknologisk anvendelse af proteiner (f.eks. vigtige industrielle enzymer)
Færdigheder:
- Vurdere sammenhængen mellem proteiners struktur og funktion
- Kunne foretage kvantitativ analyse af bindingsdata, f.eks. ved hjælp af et Scatchard plot
- Anvende sekvens og strukturdatabaser samt internetbaserede redskaber til basal karakterisering af en proteinsekvens på forskellige strukturniveauer
- Vurdere fordele og ulemper ved heterolog proteinekspression i forskellige organismer
- Kunne beskrive sammenhængen mellem aminosyrers fysisk-kemiske egenskaber, deres reaktivitet og bidrag til proteinstruktur
- Analysere og forklare enzymkinetiske reaktioner ud fra analyser af enzymkinetiske data
- Beskrive udvalgte eksempler på hvordan specifikke proteiners struktur relaterer til deres funktionelle egenskaber i en cellulær kontekst
- Udføre laboratoriearbejde på forsvarlig vis og anvende forskelligartet apparatur i forbindelse med laboratorieøvelser
Kompetencer:
- Dokumentere (vha laboratoriejournal) og præsentere resultaterne af udførte eksperimenter
- Kombinere viden om enzymmekanismer ud fra en fortolkning af videnskabelige data
- Læse en original metodebeskrivelse og derfra skrive en forsøgsprotokol
- Kombinere viden om proteinfoldning og stabilitet til en generel forståelse af forholdet mellem in vivo og in vitro proteinfoldning
- Kritisk evaluere fordele og ulemper ved forskellige metoder til proteinoprensning og karakterisering
- Kunne anvende den opnåede viden og færdigheder til at rationalisere et givent proteins opførsel baseret på en analyse af forholdet mellem dets struktur, funktion og mekanisme
Se Absalon
- Kategori
- Timer
- Eksamen
- 4
- Forberedelse
- 304
- Forelæsninger
- 22
- Praktiske øvelser
- 50
- Teoretiske øvelser
- 32
- I alt
- 412
Som meritstuderende - klik her!
Som enkeltfags-studerende (efter- og videreuddannelse)
- klik her!
- Point
- 15 ECTS
- Prøveform
- Skriftlig prøve, 4 timer med opsyn.Kurset er udtaget til ITX-eksamen på Peter Bangs Vej.
- Krav til indstilling til eksamen
For at indstille sig til eksamen skal den studerende have deltaget i minimum 80% af øvelsestimerne, og alle rapporter og journaler skal være godkendt.
- Hjælpemidler
- Uden hjælpemidler
- Bedømmelsesform
- 7-trins skala
- Censurform
- Ekstern censur
- Reeksamen
Der kan ikke ses bort fra kravet om deltagelse i mindst 80% af øvelsestimerne, og studerende, der ikke opfylder kravet, skal derfor følge kurset igen det kommende studieår. Er kravet om deltagelse opfyldt, men ikke kravet om godkendelse af øvelsesrapporter, skal alle øvelsesrapporter være godkendt inden reeksamen.
Kriterier for bedømmelse
For at opnå karakteren 12 skal den studerende på overbevisende vis opfylde de beskrevne mål for viden, færdigheder og kompetencer i feltet "Målbeskrivelser".
Kursusinformation
- Sprog
- Dansk
- Kursuskode
- NBIB14029U
- Point
- 15 ECTS
- Niveau
- Bachelor
- Varighed
- 1 blok
- Placering
- Blok 3
- Skemagruppe
- Uden for skemastruktur
- Kursuskapacitet
- 125
- Efter- og videreuddannelse
- Studienævn
- Studienævn for Biomolekylær videnskab og Teknologi
Udbydende institut
- Biologisk Institut
Kursusansvarlige
- Lars Ellgaard (9-736c73736e6868796b4769707635727c356b72)
Undervisere
Lars Ellgaard, Kaare Teilum, Wouter Boomsma, Gert Dandanell, Kresten Lindorff-Larsen, Michael A. Sørensen