CSU2016102 Bioinformatik – anvend og forstå de hyppigst brugte værktøjer

Se kursusbeskrivelsen på kampagnesiden for Copenhagen Summer University

Forskningen i bioteknologi og molekylær biologi er i rivende udvikling, og efterhånden kan man kun få noget ud af de enorme mængder af offentligt tilgængelige informationer med en basal bioinformatisk viden. Samtidig opleves bioinformatik ofte vanskeligt tilgængeligt og svært at formidle.

På kurset vil underviserne integrere den nyeste forskning med relevante, praktiske og gratis bioinformatiske værktøjer, der kan anvendes i undervisningen. Kurset vil på en effektiv og anvendelsesorienteret måde opdatere gymnasieundervisere og andre med problemstillinger og formidlingsopgaver inden for bioinformatik. Undervisningen vil gøre deltagerne i stand til, ved hjælp af computere og statistiske værktøjer, at ekstrahere og behandle relevant biologisk viden fra de store mængder af biologisk information, der i dag er frit tilgængelig på internettet.

Dit udbytte
Deltagerne vil tilegne sig kompetencer, up-to-date viden om, hands-on erfaring med og state-of-the-art værktøjer inden for:

• Brug af sekvens- og genom-databaser

• DNA- og protein- sekvens analyse og alignment

• Molekylær fylogeni

• Protein 3D visualisering og homologi modellering

Efter endt kursus vil du være i stand til:

• At finde relevante DNA og proteinsekvenser fra internetbaserede databaser

• At analysere og aligne relevante DNA og protein sekvenser

• At generere og fortolke fylogenetiske træer på baggrund af dine egne alignments

• At modellere og visualisere 3D strukturen af relevante proteiner.

Kurset vil bidrage til udviklingen af konkret undervisningsmateriale til brug i gymnasieskolen og vil danne rammen for et fremtidigt fagligt netværk blandt deltagerne. Undervejs vil der også være tid til at spørge om dine egne bioinformatiske problemstillinger.

Kursusindhold
Kurset omfatter en blanding af forelæsninger og problemorienteret undervisning i form af computerøvelser. Computerøvelserne vil kunne inddrages enten direkte eller i modificeret form i undervisning i gymnasieskolen.

Deltagere
Kurset er både henvendt til dig, der har brug for en genopfriskning og noget hands-on erfaring, men også til dig, der ikke har prøvet kræfter med bioinformatik før. Det er målrettet undervisere i gymnasieskolen, som ønsker kompetencer til at planlægge og udføre undervisning i bioinformatik, men også andre med tilsvarende opgaver og forudsætninger kan få et højt udbytte af kurset.

Datoer
3 dage, 15. – 17. august 2016, 9:00 – 16:30, Københavns Universitet, Frederiksberg Campus.

Kursusleder
Mika Zagrobelny, lektor, Institut for Plante- og Miljøvidenskab, Københavns Universitet – sekvens- og genom-databaser, sekvens alignments, molekylær fylogeni

Andre undervisere
Lars Hemmingsen, lektor, Kemisk Institut, Københavns Universitet – 3D protein struktur modellering
Mikael Kryger Jensen, ph.d. stud., Institut for Plante- og Miljøvidenskab, Københavns Universitet – assisterer ved computerøvelser

Pris
11.400 kr. ekskl. moms. Prisen inkluderer undervisning, kursusmateriale og forplejning under kurset.